Brian Farrugia begann seine berufliche Karriere im Banking, wo er für zwei große maltesische Banken, die Bank of Valletta und die APS Bank, arbeitete, und sich auf Corporate Lending spezialisierte. Später wechselte er zur Erste Bank Malta, einer Tochtergesellschaft der Erste Bank Group of Austria, wo er für Trading Services und für das Back Office der Bank und deren Tochtergesellschaften in Malta und Übersee verantwortlich war.

Im Jahr 2005 gründete er seine eigene Firma, mit der er unter dem Handelsnamen InterLink-Corporate praktizierte. Nach einer Fusion im Jahr 2009 wurde das Unternehmen umstrukturiert und später im Jahr 2011 gründete er Quantum Group. Herr Farrugia ist Gründungsmitglied und Direktor der Quantum Group.

Herr Farrugia Berufserfahrung führte ihn zu einem Vortrag für einen Zeitraum von Banking und Finance im Malta International Training Centre in Malta und Übersee.

Er ist Governor of the Board of Governors of The Malta College of Arts, Science and Technology (MCAST). Er ist Direktor der Bank of Valletta Asset Management Limited und Mitglied des National General Contracting Committee.

Herr Farrugia führt sein Studium im Bereich Strategic & Financial Management an der Universität von Maastricht (Niederlande) weiter. Er ist Associate des Chartered Institute of Bankers.